Az antracén (ANT) inklúziós viselkedése három ciklodextrinben (Betacyclodextrin, hidroxi -propil -tacyclodextrin ésszulfobutilbetaciklodextrin) Molecular Dynamics (MD) szimulációkkal vizsgálták. Az MD eredmények azt mutatták, hogy a hangya spontán módon bejuthat e három ciklodextrin üregébe. A különbség az, hogy a szulbutilbetaciklodextrinnel csomagolva az hangya csak a szulbutilbetaciklodextrin széles szélén keresztül léphet be az üregbe. Ezután a 2- hidroxi -propil (HP) és a szulfonált butil (SBE) szubsztituensek hatásait a ciklodextrinek szerkezetére vizsgáltuk az egyes ciklodextrinok glükózegységeinek szerkezeti torzulásának elemzésével.
Megállapítást nyert, hogy a semleges betacyclodextrinek kúpos struktúrát mutatnak, és a HP vagy SBE csoportok jelenléte nagymértékben befolyásolta a szerkezetet. A másodlagos él szűkül a glükóz egység megfordításának, amelyet a szubsztituens csoport ingadozása okoz. Amikor a hangyát beillesztették az üregbe, a három ciklodextrin üregkonformációját bizonyos mértékig helyreállítottuk. Ugyanakkor a szubsztituens csoport az üreg tengelye mentén nyúlik, és kölcsönhatásba lép a vendégmolekulával.
Az egyes ciklodextrin és hangyák közötti kölcsönhatás elemzésével azt találták, hogy a helyettesítő csoportok kibővítették a hidrofób üreg térfogatát. Mind a szubsztituens csoportok, mind a glükóz egységek hozzájárulnak a vendégmolekulával való kölcsönhatáshoz. A ciklodextrin gyűrű konformációs változásai az üreg összehúzódásához vezetnek, ami lehetővé teszi, hogy szorosan kötődjön a hangya molekulákhoz.
